Huyện Ngọc Sơn được chia ra làm 18 đơn vị hành chính cấp hương, gồm 2 nhai đạo, 10 trấn và 6 hương

• Nhai đạo: Băng Khê (冰溪街道), Văn Thành (文成街道)
• Trấn: Lâm Hồ (临湖镇), Tất Mỗ (必姆镇), Hoành Nhai (横街镇), Hạ Trấn (下镇镇), Nham Thụy (岩瑞镇), Song Minh (双明镇), Tử Hồ (紫湖镇), Tiên Nham (仙岩镇), Chương Thôn (樟村镇), Phong Lâm (枫林镇)
• Hương: Nam Sơn (南山乡), Hoài Ngọc (怀玉乡), Hạ Đường (下塘乡), Tứ Cổ Kiều (四股桥乡), Lục Đô (六都乡), Tam Thanh (三清乡)